除菌過濾是指采用物理截留的方法除去氣體或液體中的微生物，以達到無菌藥品要求的過程。
無菌藥品是指法定藥品標準中列有無菌檢查項目的制劑和原料藥，包括無菌制劑和無菌原料藥。
無菌藥品應當盡可能采用加熱方式進行最終滅菌，最終滅菌產品中的微生物存活率（即無菌保證水平SAL）不得高于10的負6次方，對熱不穩定的產品可采用無菌生產操作或過濾除菌的方法。
除菌級過濾器每平方厘米有效過濾面積可以截留≥10 7CFU的缺陷短波單胞菌的過濾器，工藝上常用0.22um（更小孔徑或相同過濾效力）的除菌級過濾器。
除菌過濾器的種類
1. 根據濾芯材質分類
①聚四氟乙烯 （PTFE）材質，過濾氣體及有機溶劑
②聚醚砜（PES）材質，液體，包括培養基，緩沖液的過濾
③聚偏二氟乙烯（PVDF）材質，液體過濾，蛋白含量低的液體，包括病毒收獲液，活性成分注射液等。
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除菌過濾器性能評價指標
1. 兼容性
①濾器與料液的化學兼容性，即不與料液發生化學反應。
②濾器對料液組分的吸附
③料液和工藝條件對過濾器的影響，包括過濾后濾器的完整性，過濾后料液中的可提取物，過濾后濾器的重量及濾器對料液的吸附。
2. 截留率
①需有效去除顆粒，細菌，支原體
②每平方厘米有效過濾面積可以截留10的7次方CFU缺陷短波單胞菌
③基于料液和工藝條件評估除菌過濾器的細菌截留能力。
3. 過濾通量
①單位時間，單位面積處理的料液體積。
②是評價過濾器過濾快慢的指標，需要在特定的跨膜壓下完成。
4. 過濾載量
單位膜面積處理的料液體積，是評價過濾器過濾體積大小的指標，過濾通量衰減會影響最終過濾載量。
除菌過濾器選型
1. 氣體過濾器
材質：聚四氟乙烯 （PTFE材質）
氣體除菌過濾器選擇考慮因素：
①疏水濾器
②耐受高溫氣體和氧化
③ 除菌級濾器
④在特定的進口壓力下，基于跨膜壓與氣體流量選擇合適濾器。
2. 液體除菌過濾器
材質：
①聚偏二氟乙烯（PVDF材質），電鏡圖片為對稱結構，耐受pH＜10，耐受醇類，低蛋白吸附性，過濾通量一般，應用于終端除菌過濾，病毒類料液的過濾。
②聚醚砜（PES材質），電鏡圖片為不對稱結構，上層寬松，下層致密，耐受pH 1-14，醇類不耐受，輕微蛋白吸附性，過濾通量良好，應用于中間體過濾，培養基緩沖液過濾。
液體除菌過濾器選擇考慮因素
①濾器親水性和疏水性
②對料液的化學兼容性
③除菌級濾器
④基于工藝要求進行濾器選型實驗，分析堵塞類型，根據濾器載量和通量計算過濾器面積。
